Čeští vědci vyluštili záhadný genetický kód nově objeveného parazita

Nový druh cizopasníka objevený v plošticích na Turnovsku představuje mimořádný objev. Ukázalo se totiž, že parazit má naprosto nepředvídatelnou a výraznou odchylku od genetického kódu, který je jinak úplně stejný u drtivé většiny organismů včetně člověka. Rozluštění této genetické záhady, o něž se postarali výhradně čeští molekulární biologové především z Mikrobiologického ústavu AV ČR a Parazitologického ústavu Biologického centra AV ČR s podporou Grantové agentury ČR, otiskl prestižní odborný časopis Nature.

Ačkoli nově popsaný parazitický prvok Blastocrithidia nonstop nenapadá přímo člověka, je blízce příbuzný trypanozomám, které způsobují řadu závažných chorob, například spavou nemoc. Díky své genetické „úchylce“ je nový prvok velmi cenný pro další biologický výzkum, protože může vědcům umožnit dosud nepředstavitelné manipulace s genetickým kódem.

Plostice Eysarcoris aeneus FOTO Miroslav Fiala

Ploštice Eysarcoris aeneus , foto: Miroslav Fiala

Genom je jako kniha plná vět – genů

Genetická informace je uložena v molekulách DNA, jejichž jednotlivé úseky označujeme jako geny a jejich soubor v daném organismu se nazývá genom. Každý gen v sobě obsahuje recept na výrobu jedné bílkoviny, která vzniká různými kombinacemi dvaceti základních aminokyselin procesem zvaným proteosyntéza. Pro jednoduchost si lze gen představit jako jednu větu začínající velkým písmenem a končící tečkou, zatímco genom je kniha vyprávějící celý příběh. Velká písmena a tečky oddělují jednotlivé věty a dávají tak celému příběhu jasnou strukturu a smysl (viz obr.).

Obr.: Leoš Valášek, Mikrobiologický ústav AV ČR

Nedávno se však ukázalo, že existují organismy, do jejichž vět pronikly tečky navíc, a to tak, že nahradily specifická písmena libovolných slov (E a V, které značí konkrétní aminokyseliny).
V důsledku toho jsou čtenáři (v případě genomu se jedná o buněčné luštitele genetického kódu – tzv. ribozomy) zmateni, kde věty skutečně končí, a příběh se stává zcela nesrozumitelným (viz obr.). V přeneseném slova smyslu by se dalo říci, že u nich došlo k biblickému zmatení jazyků jako v pradávné říši Babylonské.

Snad nejzmatenější ze všech je právě nově popsaný druh trypanozomy, parazitující v českých plošticích. Vědci z Parazitologického ústavu Biologického centra a Mikrobiologického ústavu AV ČR objevili molekulární mechanismus, který se u tohoto prvoka vyvinul, aby čtenář (ribozom) mohl procházet jeho genetickými větami tak, jako by v nich žádné tečky navíc nebyly. Věty jsou však natolik specificky zašifrované, že čtenáři (ribozomy) žádných jiných organismů nedokážou příběh (genetickou informaci) správně rozluštit.

„Trik spočívá v povaze a délce molekuly transferové RNA (tRNA), která ribozomu běžně slouží jako luštitelská příručka, a v jedinečné úpravě jedné bílkoviny, která v buňkách za normálních okolností zajišťuje rozpoznávání teček, tedy přesné ukončení proteosyntézy,“ vysvětluje Leoš Valášek z Mikrobiologického ústavu AV ČR. Součinností těchto dvou upravených molekul pozná ribozom tohoto prvoka, kdy má, nehledě na spoustu teček, větu správně ukončit, a kdy má tečky naopak nahradit dvěma původními písmenky (E a V), což příběhu (genetické informaci) vrátí smysl (viz obr.).

Blastocrithidia obr 02 FOTO Jan Votýpka

Parazitický prvok Blastocrithidia nonstop, foto: Jan Votýpka

 

„Vypadá to tak trochu jako opravený diktát nepozorného žáka základní školy, ale jak přesvědčivě ukazuje studovaná trypanozoma, dá se s tím dobře žít. Jedná se o naprosto nečekaný a dramatický odklon od standardního genetického kódu, který je podstatou všeho živého,“ dodává další z autorů objevu, Zdeněk Paris z Parazitologického ústavu Biologického centra AV ČR.

Tento objev je důležitý nejen pro základní biologický výzkum, ale i pro nejnovější vědecké trendy, jakým je např. syntetická biologie, jejímž cílem je uměle vytvořit a vylepšit produkci a vlastnosti biologických látek pro nejrůznější účely.

„Cílená podpora excelentní vědy a vědeckých projektů umožňuje dosáhnout výsledků, které, jako je to v tomto případě, mění pohled na základní fungování světa. Jsem rád, že naše financování umožňuje českým vědcům dosáhnout těchto fascinujících objevů,“ dodává Petr Baldrian, předseda Grantové agentury ČR, která financuje excelentní základní výzkum.

 

Přírodovědci z Univerzity Karlovy budou spolu s brazilskými kolegy zkoumat ukládání uhlíku v oceánech

Grantová agentura České republiky (GA ČR) společně s brazilskou São Paulo Research Foundation (FAPESP) rozhodla o podpoře projektu „Produktivita, ventilace a rozpouštění karbonátu jako proxy procesu ukládání uhlíku v oceánech-studie z J-JV části Brazilského kontinentálního okraje“ podaným RNDr. Filipe Scheinerem, Ph.D. (Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy) a prof. Karen Badaraco Costa (University of São Paulo). Řešení projektu bude trvat 3 roky.

Financování projektu je možné díky spolupráci GA ČR a FAPESP. Projekt prošel úspěšně hodnoticím procesem obou agentur. Každá z institucí bude financovat tu část nákladů, která náleží vědcům z daného státu.

Oznámení o výsledcích veřejné soutěže na podporu grantových projektů Mezinárodní projekty – 2023 – the São Paulo Research Foundation (Brazílie) – FAPESP (pdf)

 

Výzva pro podávání slovinsko-českých projektů

Grantová agentura České republiky (GA ČR) vyhlašuje výzvu pro podávání projektů na principu hodnocení Lead Agency s předpokládaným počátkem řešení v roce 2023. Výzva se týká projektů financovaných ve spolupráci se slovinskou agenturou Javna agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije (ARRS) v rámci iniciativy Weave. V této výzvě vystupuje slovinská agentura ARRS jako Lead Agency, tedy hodnotí návrhy projektů po vědecké stránce a GA ČR výsledky hodnoticího procesu přebírá.

 

Přihláška

Soutěžní lhůta začíná 11. 1. 2023. Českou část přihlášky je možné podávat nejpozději do 7. 3. 2023, tedy do 7 dnů po oficiálním deadlinu 28. 2. 2023, který stanovila pro slovinské uchazeče agentura ARRS. Čestná prohlášení/prohlášení o způsobilosti/výpis z evidence skutečných majitelů* na základě § 14 odst. 3 písm. e) zákona č. 218/2000 Sb. o rozpočtových pravidlech a o změně některých souvisejících zákonů (rozpočtová pravidla), ve znění pozdějších předpisů zasílejte do datové schránky a8uadk4 do výše uvedeného termínu podání české části přihlášky, jako předmět zprávy uveďte „Způsobilost“. Pokud uchazeč způsobilost v letošním roce již doložil a nedošlo k žádné změně, není třeba ji dokládat znovu.

Upozorňujeme, že je nezbytné ze strany společného mezinárodního týmu zajistit podání přihlášky ve výše uvedených lhůtách jak k ARRS (podle příslušných pravidel ARRS), tak ke GA ČR, tj. slovinským navrhovatelem k ARRS a českým navrhovatelem ke GA ČR. Nedojde-li ke spárování obou žádostí o grant, je přihláška z hodnocení vyřazena. U trilaterálních projektů musí být přihláška podána také ke třetí příslušné agentuře.

Pravidla pro podávání návrhů projektů a formuláře čestných prohlášení k prokázání způsobilosti naleznete níže v příloze nebo v záložce „Zadávací dokumentace“.

Projekty jsou max. tříleté, GA ČR umožňuje délku trvání projektu 24, nebo 36 měsíců.

 

*Uchazeč je podle ustanovení § 14 odst. 3 písm. e) rozpočtových pravidel povinen předložit údaje o skutečném majiteli právnické osoby podle zákona upravujícího evidenci skutečných majitelů (zákon č. 37/2021 Sb., o evidenci skutečných majitelů, ve znění pozdějších předpisů), a to ve formě úplného výpisu platných údajů a údajů, které byly vymazány bez náhrady nebo s nahrazením novými údaji, jedná-li se o evidující osobu; v případě, že je žadatel o dotaci zahraniční právnickou osobou, doloží údaje o svém skutečném majiteli buď výpisem ze zahraniční evidence obdobné evidenci skutečných majitelů, nebo, pokud taková zahraniční evidence neexistuje, sdělí identifikační údaje všech osob, které jsou skutečným majitelem zahraniční právnické osoby, a předloží doklady, z nichž vyplývá vztah všech osob k zahraniční právnické osobě, zejména výpis ze zahraniční evidence obdobné obchodnímu rejstříku, seznam akcionářů, rozhodnutí statutárního orgánu o vyplacení podílu na zisku, společenská smlouva, zakladatelská listina nebo stanovy.

 

Souběhy návrhů projektů

Pro souběhy návrhů projektů, ve kterých vystupuje stejná osoba navrhovatele nebo spolunavrhovatele, platí pravidlo stanovené v čl. 3 odst. 17 Pravidel.

Návrhy projektů podané do této výzvy se budou započítávat do maximálního počtu návrhů projektů podaných do výzev s předpokládaným počátkem řešení v roce 2023.

 

Potřebujete poradit?

Helpdesk GA ČR

Oddělení mezinárodních vztahů

 

Další informace a odkazy

 

SOUVISEJÍCÍ ČLÁNKY

Technická odstávka serverů

V sobotu 7. ledna proběhne technická odstávka serverů www.GACR.cz a grantového informačního systému www.GRIS.cz. Jejich opětovné zprovoznění se předpokládá v noci ze soboty na neděli 8. ledna. Omlouváme se za možné komplikace a děkujeme za pochopení.

SOUVISEJÍCÍ ČLÁNKY

Nové složení Vědecké rady GA ČR

Vláda s účinností od 22. prosince 2022 jmenovala do funkce osm z dvanácti členů Vědecké rady GA ČR (VR). Šest z nich bude v tomto orgánu působit poprvé.

Do čela VR byl nově jmenován stávající člen VR doc. Dr. Phil. Rudolf Kučera, Ph.D.

Složení VR od 22. 12. 2022

Vědecká rada GA ČR je koncepčním orgánem GA ČR. Má dvanáct členů, které z řad odborníků jmenuje a odvolává vláda na návrh Rady pro výzkum, vývoj a inovace. Funkční období jejích členů je čtyřleté s možností jmenování nejvýše na dvě období po sobě následující. Vědecká rada navrhuje předsednictvu ustavení a zaměření oborových komisí, skupiny projektů a jejich zaměření, vyhodnocuje vědeckou úroveň GA ČR a navrhuje potřebná opatření.

SOUVISEJÍCÍ ČLÁNKY

Doplňující výzva do panelů

Od 1. dubna 2023 dojde k výměně přibližně poloviny členů hodnoticích panelů GA ČR. Po vyhodnocení výzvy k nominacím vyhlášené v říjnu 2022, GA ČR hledá odborníky zejména do následujících panelů:

Nominační formulář

Nominace, které budou brány v úvahu pro funkční období od 1. dubna 2023, zasílejte do nejpozději 31. ledna 2023.

Důležité upozornění: V případě, že do jednoho pracovního dne nepřijde potvrzení nominace, prosím, kontaktujte náš helpdesk.

SOUVISEJÍCÍ ČLÁNKY

Nové projekty s korejskými a tchajwanskými vědci

Čtyři nové projekty se začnou od ledna 2023 řešit díky spolupráci GA ČR se dvěma asijskými agenturami. Jeden korejsko-český projekt bude podpořen společně s korejskou agenturou Korea Research Foundation, s níž GA ČR spolupracuje již od roku 2005. Další tři tchajwansko-české projekty budou podpořeny společně s tchajwanskou agenturou National Science and Technology Council, se kterou probíhá spolupráce již od roku 2008.

Korejsko-český projekt (NRF – GA ČR)

 

23-04676J doc. Ing. Radek Kolman, Ph.D. Řiditelná úchopová mechanika: Modelování, řízení a experimenty Ústav termomechaniky AV ČR, v.v.i.

Oznámení o výsledcích veřejné soutěže na podporu grantových projektů Mezinárodní projekty – 2023 – the National Research Foundation of Korea (Korea) – NRF (pdf)

 

Tchajwansko-české projekty (NSTC – GA ČR)

23-07621J Václav Vencovský Otoakustické emise v normální kochlee a při přetlaku v endolymfatickém prostoru kochley: modelování a experimenty České vysoké učení technické v Praze, Fakulta elektrotechnická
23-06525J Prof. Dr. Norbert Müller Specifické interakce adhesinů evropských spirochet Lymské boreliózy s glykosyaminoglykany s přesně definovanou strukturou v atomárním rozlišení Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta
23-06301J Mgr. Viswanath Das, Ph.D. Zkoumání účinků tau mutací na aktivitu VQIVYK-cílících látek na tau seeding u neurodegenerativních onemocnění Univerzita Palackého v Olomouci, Lékařská fakulta

 

Oznámení o výsledcích veřejné soutěže na podporu grantových projektů Mezinárodní projekty – 2023 – the National Science and Technology Council (Taiwan) – NSTC (pdf)

 

Všechny projekty úspěšně prošly hodnoticím procesem GA ČR a příslušné zahraniční agentury. Každá z agentur financuje náklady vědců ze svého státu.

Výsledky dalších mezinárodních výzev budou oznámeny po jejich potvrzení partnerskou agenturou.

 

SOUVISEJÍCÍ ČLÁNKY

Výzva pro podávání lucembursko-českých projektů

Grantová agentura České republiky (GA ČR) vyhlašuje výzvu pro podávání projektů na principu hodnocení Lead Agency s předpokládaným počátkem řešení v roce 2024. Výzva se týká projektů financovaných ve spolupráci s lucemburskou agenturou National Research Fund (FNR) v rámci iniciativy Weave. V této výzvě vystupuje lucemburská agentura FNR jako Lead Agency, tedy hodnotí návrhy projektů po vědecké stránce a GA ČR výsledky hodnoticího procesu přebírá.

 

Přihláška

Soutěžní lhůta začíná 19. 12. 2022. Českou část přihlášky je možné podávat nejpozději do 27. 4. 2023, tedy do 7 dnů po oficiálním deadlinu 20. 4. 2023 ve 14:00, který stanovila pro lucemburské uchazeče agentura FNR. Čestná prohlášení/prohlášení o způsobilosti/výpis z evidence skutečných majitelů* na základě § 14 odst. 3 písm. e) zákona č. 218/2000 Sb. o rozpočtových pravidlech a o změně některých souvisejících zákonů (rozpočtová pravidla), ve znění pozdějších předpisů zasílejte do datové schránky a8uadk4 do výše uvedeného termínu podání české části přihlášky, jako předmět zprávy uveďte „Způsobilost“.

Upozorňujeme, že je nezbytné ze strany společného mezinárodního týmu zajistit podání přihlášky ve výše uvedených lhůtách jak k FNR (podle příslušných pravidel FNR), tak ke GA ČR, tj. lucemburským navrhovatelem k FNR a českým navrhovatelem ke GA ČR. Nedojde-li ke spárování obou žádostí o grant, je přihláška z hodnocení vyřazena. U trilaterálních projektů musí být přihláška podána také ke třetí příslušné agentuře.

Pravidla pro podávání návrhů projektů a formuláře čestných prohlášení k prokázání způsobilosti naleznete níže v příloze nebo v záložce „Zadávací dokumentace“.

 

Projekty jsou max. tříleté, GA ČR umožňuje délku trvání projektu 24, nebo 36 měsíců.

*Uchazeč je podle ustanovení § 14 odst. 3 písm. e) rozpočtových pravidel povinen předložit údaje o skutečném majiteli právnické osoby podle zákona upravujícího evidenci skutečných majitelů (zákon č. 37/2021 Sb., o evidenci skutečných majitelů, ve znění pozdějších předpisů), a to ve formě úplného výpisu platných údajů a údajů, které byly vymazány bez náhrady nebo s nahrazením novými údaji, jedná-li se o evidující osobu; v případě, že je žadatel o dotaci zahraniční právnickou osobou, doloží údaje o svém skutečném majiteli buď výpisem ze zahraniční evidence obdobné evidenci skutečných majitelů, nebo, pokud taková zahraniční evidence neexistuje, sdělí identifikační údaje všech osob, které jsou skutečným majitelem zahraniční právnické osoby, a předloží doklady, z nichž vyplývá vztah všech osob k zahraniční právnické osobě, zejména výpis ze zahraniční evidence obdobné obchodnímu rejstříku, seznam akcionářů, rozhodnutí statutárního orgánu o vyplacení podílu na zisku, společenská smlouva, zakladatelská listina nebo stanovy.

 

Souběhy návrhů projektů

Pro souběhy návrhů projektů, ve kterých vystupuje stejná osoba navrhovatele nebo spolunavrhovatele, platí pravidlo stanovené v čl. 3 odst. 17 Pravidel s tím rozdílem, že projekty podané do této výzvy se budou započítávat do maximálního počtu návrhů projektů podaných do výzev s předpokládaným počátkem řešení v roce 2024.

Návrhy projektů podané do této výzvy se nebudou započítávat do maximálního počtu návrhů projektů podaných do výzev s předpokládaným počátkem řešení v roce 2023.

 

Potřebujete poradit?

Helpdesk GA ČR

Oddělení mezinárodních vztahů

 

Další informace a odkazy

 

SOUVISEJÍCÍ ČLÁNKY

Informace pro řešitele: Termíny podání dílčích, průběžných a závěrečných zpráv (+ videonávod)

 

V aplikaci pro podávání a správu grantových projektů GRIS byly zpřístupněny formuláře dílčích (finančních), průběžných (odborných) a závěrečných (odborných) zpráv.

Termíny

Termín pro odevzdání dílčích zpráv: 17. 1. 2023
Termín pro odevzdání závěrečných zpráv: 31. 1. 2023
Termín pro odevzdání dílčích finančních a průběžných odborných zpráv pro projekty EXPRO a JUNIOR STAR: 31. 1. 2023

Videonávod k dílčím zprávám

Se správným vyplněním dílčích zpráv v aplikaci GRIS letos řešitelům pomůže i nový videonávod:

Potřebujete poradit?

V případě zjištění nesrovnalostí ve formuláři zprávy nebo jakýchkoliv dotazů se prosím obraťte na Helpdesk GA ČR:

Tel: 227 088 841 (Po–Čt: 9–16 h; Pá: 9–15 h)

E-mail: info@gacr.cz (pro všeobecné dotazy) nebo kontakty@gacr.cz (pro hesla, založení nových účtů v GRIS a změny osob a institucí)

SOUVISEJÍCÍ ČLÁNKY

Dalších šest česko-polských projektů se začne řešit příští měsíc

Na základě iniciativy WEAVE podpoří GA ČR ve spolupráci s polskou agenturou Narodowe Centrum Nauki (NCN) od ledna šest nových projektů. Na řešení tříletých projektů se budou podílet vědci z obou zemí. Návrhy projektů prošly hodnocením formou Lead Agency, kdy pouze jedna z agentur projekty hodnotí a druhá od ní hodnocení přebírá. GA ČR v tomto případě plnila roli hodnoticí agentury. Každá z agentur financuje náklady vědců ze své země.

 

Projekty financované GA ČR a NCN

Registrační číslo Navrhovatel Název Uchazeč
23-07585K Ing. Jan Grym Ph.D. Heterostruktury nanodrátů ZnO/(Al,Ga)N pro optoelektroniku Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v.v.i.
23-05263K RNDr. Tomáš Novotný Ph.D. Supravodivé nanohybridy mimo rovnováhu Univerzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakulta
23-06199K Assoc. Prof. Hans Gorris Ph.D Nové anti-Stokesové lanthanoidové nanočástice a vícebarevný FRET mechanismy pro jednomolekulové sekvenování DNA Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta
23-05974K RNDr. Jan Kratzer Ph.D. Všestranné plazmové zdroje a pokročilé přístupy ke zpracování signálu jako nové koncepty ve stopové prvkové analýze a atomové spektrometrii Ústav analytické chemie AV ČR, v.v.i.
23-06303K doc. Mgr. Petr Beneš Ph.D. Izoforma tropomyosinu Tpm2.3 v regulaci dynamiky aktinu a tvorby metastáz u osteosarkomu Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta
23-05403K Ing. Jan Pergl Ph.D. Dopady nepůvodních a původních druhů dřevin na vegetaci a půdu: dvě strany téže mince? Botanický ústav AV ČR, v. v. i.

 

Oznámení o výsledcích společné výzvy k podávání česko-polských projektů hodnocených na principu LA v základním výzkumu (pdf)

Výsledky dalších mezinárodních výzev budou oznámeny po jejich potvrzení partnerskou agenturou.

SOUVISEJÍCÍ ČLÁNKY